Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J244

TRAV3, T-cell receptor alpha variable 3 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV3A0A0B4J244 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms