Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC084759.3-201ENST00000624468 3944 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GFM2-202ENST00000345239 2856 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 XKRX-201ENST00000372956 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C6orf222-201ENST00000437635 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEC16B-201ENST00000308284 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CYP4A11-203ENST00000371905 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABCC11-201ENST00000353782 4463 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL356019.2-201ENST00000556738 3829 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLIP1-213ENST00000540338 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRM1-207ENST00000507907 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC4C-201ENST00000278198 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC004877.1-201ENST00000608963 4093 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF548-202ENST00000366197 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALDH1L1-206ENST00000455064 3137 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTCL1-207ENST00000518815 3963 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PHKG1P1-201ENST00000442924 614 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms