Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
FOXD1Q16676 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms