Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms