Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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