Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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