Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCOA3Q9Y6Q9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA3Q9Y6Q9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms