Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP7AQ9Y3A4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP7AQ9Y3A4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms