Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ICE1Q9Y2F5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms