Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms