Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms