Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms