Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN7L1Q9ULK2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATXN7L1Q9ULK2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms