Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms