Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms