Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP4Q9UKK3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms