Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIKQ9UKE5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNIKQ9UKE5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms