Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAX2Q9UIW0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms