Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP25Q9UHP3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP25Q9UHP3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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