Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms