Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIP2Q9UDT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms