Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms