Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCHIP1Q9P0W5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms