Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms