Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms