Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPMQ9NSP4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms