Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms