Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB9BQ9NP90 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB9BQ9NP90 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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