Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGAP3Q9NP61 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms