Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms