Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP29Q9HBJ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP29Q9HBJ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP29Q9HBJ7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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USP29Q9HBJ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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USP29Q9HBJ7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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USP29Q9HBJ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP29Q9HBJ7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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