Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms