Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC86Q9H6F5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms