Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COMMD5Q9GZQ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COMMD5Q9GZQ3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COMMD5Q9GZQ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COMMD5Q9GZQ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms