Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BPESC1Q9GZL8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms