Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AMBRA1Q9C0C7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms