Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms