Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms