Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIFKQ9BYG3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIFKQ9BYG3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms