Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP58Q9BVL2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP58Q9BVL2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms