Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM43Q9BTV4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms