Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM29Q9BSF4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms