Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPIFA3Q9BQP9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms