Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms