Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms