Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNS3Q9BQ31 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNS3Q9BQ31 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms