Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAP1L3Q99457 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAP1L3Q99457 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms