Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCLRE1CQ96SD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms