Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGSQ96S52 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGSQ96S52 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms