Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms